由于鐵觀音含有較多的多酚類、醛類及醇類等物質，這些物質對健康人群并沒有多少影響，但對胃腸功能差，尤其本身就有慢性胃腸道炎癥的病人來說，這些物質就會刺激胃腸黏膜，原本胃腸功能較差的人更容易誘發胃病因此不宜多喝。 此外鐵觀音中還含有較多的咖啡因、活性生物堿以及多種芳香物質，這些物質還會使人的中樞神經系統興奮，有神經衰弱、心腦血管病的患者應適量飲用，而且不宜在睡前或空腹時飲用。